Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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