Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NFIAQ12857 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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