Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SREBF2Q12772 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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