Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms