Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC8Q09428 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC8Q09428 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms