Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms