Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms