Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSPL2Q05D32 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSPL2Q05D32 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms