Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FPGSQ05932 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms