Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN1Q04323 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms