Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD4Q01804 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms