Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CACNA1BQ00975 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms