Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2BQ00403 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms