Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HTRA4P83105 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms