Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMF1P82094 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMF1P82094 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMF1P82094 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms