Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SMARCA4P51532 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMARCA4P51532 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms