Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NESP48681 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NESP48681 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NESP48681 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NESP48681 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms