Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms