Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC1A2P43004 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC1A2P43004 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC1A2P43004 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC1A2P43004 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC1A2P43004 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms