Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MTHFRP42898 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms