Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF9P41273 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms