Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP5C1P36542 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms