Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms