Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLD1P28340 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms