Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO2P25791 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO2P25791 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms