Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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