Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms