Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDSP20132 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDSP20132 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDSP20132 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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