Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPCAMP16422 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms