Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC130P13994 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms