Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms