Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRFP10586 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRFP10586 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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