Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM228BP0C875 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms