Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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