Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAPGEF3O95398 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEF3O95398 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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