Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GABARAPO95166 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms