Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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