Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP17L12C9JPN9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms