Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD1B0YJ81 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms