Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC169A6NNP5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms