Protein–RNA interactions for Protein: A6NEE1

PLEKHD1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHD1A6NEE1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLEKHD1A6NEE1 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms