Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms