Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms