Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms