Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCAF1Q9Y4C2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms