Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54L2Q9Y4B4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms