Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms