Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms