Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
L1RE1Q9UN81 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms