Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBE1Q9UJT0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBE1Q9UJT0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms